Πολύ σύνηθες φαινόμενο τα τελευταία χρόνια στο Χόλιγουντ είναι το γεγονός οι διάσημοι να προσπαθούν να ενταχθούν στους κόλπους της Σαϊεντολογίας.
Όπως αναφέρει σε δημοσίευμά του το Page Six, ο Μπραντ πέρασε τρία χρόνια στους κόλπους της οργάνωσης και συμμετείχε σε τελετές, συνεδρίες και ειδικά μαθήματα. «Πηγή» της The Sun μέσα από την Εκκλησία της Σαϊεντολογίας στο Πόρτλαντ δήλωσε ότι πριν γίνει γνωστός ο ηθοποιός είχε δοκιμάσει την «εκπαίδευση» της θρησκευτικής ομάδας, χωρίς τελικά να καταφέρει να ταιριάξει με τα «πιστεύω» της.
Η «πηγή» αναφέρει ότι ο Πιτ λάμβανε μέρος σε πολύωρες τελετές εξαγνισμού, οι οποίες γίνονταν σε σάουνα και μαζί του ήταν υποχρεωτικά η (λεγόμενη) «δίδυμή» του – μια κοπέλα 15 ετών την οποία είχαν ορίσει να παρακολουθεί την πρόοδό του. Η κοπέλα ήταν η κόρη ενός εξέχοντος μέλους του κινήματος της Σαϊεντολογίας και είχε οριστεί να έχει την ευθύνη του Πιτ – όπως και εκείνος θα είχε την ευθύνη αντίστοιχα της κοπέλας. «Ήταν σίγουρα μαζί του στη σάουνα, αλλά δεν ήταν τίποτα πονηρό» ανέφερε η «πηγή».
Όπως εξηγεί η Sun, η παράξενη χρήση σάουνας (μαζί με βιταμίνες και γυμναστική) εντάσσεται στο πλαίσιο της διαδικασίας εξαγνισμού που ανέπτυξε ο ιδρυτής της Σαϊεντολογίας Λ. Ρον Χάμπαρντ. Σύμφωνα με αρχεία της εκκλησίας της Σαϊεντολογίας, ο Πιτ ολοκλήρωσε κάποιες συνεδρίες τον Ιούλιο του 1991 και «ένα ειδικό μάθημα για την ανθρώπινη αξιολόγηση» τον Μάιο του 1993. Μέρος της εκπαίδευσής του αποτελούσαν και κάποιες φραστικές επιθέσεις, τις οποίες ο ηθοποιός δεν φάνηκε να δέχεται και εγκατέλειψε τρέχοντας της Εκκλησία. Η Λούις κατάφερε να πείσει τον Πιτ να επιστρέψει, αλλά όχι για πολύ. Το 1993 έκλεισε την πόρτα πίσω του και δεν ξαναγύρισε. Εκείνη παρέμεινε.
O Μπραντ Πιτ μιλώντας για τη Λιούις το 1995 στο Vanity Fair, είχε πει όταν ήταν μια από τις καλύτερες σχέσεις του: «Ακόμα την αγαπώ. Περάσαμε τέλεια μαζί. Το θέμα είναι ότι μεγαλώνουμε με την ιδέα ότι η αγάπη τα νικάει όλα και απλά αυτό δεν ισχύει». Ο σταρ του Fight Club ήταν 27 ετών όταν γνώρισε τη Λιούις, που ήταν ακόμα έφηβη μετά την ταινία «Too Young to Die». Παρά τα 10 χρόνια που τους χώριζαν έκαναν έναν θυελλώδη τριετή δεσμό, στον οποίο αναφέρεται με τρυφερότητα και η Λιούις σε συνεντεύξεις της. Εκπρόσωπος του Μπραντ Πιτ δεν σχολίασε τα δημοσιεύματα, πάντως τα social δεν φαίνεται να «τσιμπάνε» με τη Σαϊεντολογία.